Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OTX2P32243 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OTX2P32243 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTX2P32243 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTX2P32243 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTX2P32243 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTX2P32243 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OTX2P32243 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms