Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RRM2P31350 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RRM2P31350 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RRM2P31350 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RRM2P31350 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RRM2P31350 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RRM2P31350 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RRM2P31350 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RRM2P31350 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RRM2P31350 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms