Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXC12P31275 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms