Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLIP1P30622 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CLIP1P30622 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms