Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CASP1P29466 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CASP1P29466 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CASP1P29466 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP1P29466 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP1P29466 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP1P29466 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP1P29466 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP1P29466 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CASP1P29466 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms