Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSSP25774 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms