Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCP23508 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCP23508 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCP23508 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCP23508 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCP23508 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCP23508 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCP23508 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCCP23508 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms