Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTPRGP23470 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
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