Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms