Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C4BPBP20851 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C4BPBP20851 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms