Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
NTF3P20783 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
NTF3P20783 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms