Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
LMNB1P20700 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LMNB1P20700 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms