Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD53P19397 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD53P19397 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD53P19397 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CD53P19397 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD53P19397 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CD53P19397 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms