Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RCC1P18754 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RCC1P18754 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms