Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA1P17302 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA1P17302 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA1P17302 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA1P17302 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA1P17302 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA1P17302 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GJA1P17302 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GJA1P17302 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GJA1P17302 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GJA1P17302 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GJA1P17302 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms