Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNB3P16520 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNB3P16520 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GNB3P16520 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms