Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms