Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GIMD1P0DJR0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms