Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX58O95786 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX58O95786 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX58O95786 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX58O95786 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX58O95786 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX58O95786 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms