Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GABARAPO95166 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms