Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KIAA0556O60303 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KIAA0556O60303 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms