Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ACOX3O15254 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACOX3O15254 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACOX3O15254 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACOX3O15254 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACOX3O15254 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms