Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms