Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NL46 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NL46 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NL46 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NL46 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NL46 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NL46 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NL46 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NL46 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NL46 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NL46 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A6NL46 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A6NL46 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
A6NL46 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
A6NL46 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms