Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VPS37CA5D8V6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS37CA5D8V6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms