Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
E2F8A0AVK6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
E2F8A0AVK6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms