Protein–RNA interactions for Protein: V9GXZ4

FPGT-TNNI3K, FPGT-TNNI3K readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FPGT-TNNI3KV9GXZ4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms