Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
LINC01558Q9Y6Z2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms