Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KIF3AQ9Y496 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KIF3AQ9Y496 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms