Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HDGFL3Q9Y3E1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms