Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MRPS28Q9Y2Q9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms