Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD4BQ9Y2L6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD4BQ9Y2L6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD4BQ9Y2L6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD4BQ9Y2L6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD4BQ9Y2L6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD4BQ9Y2L6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FRMD4BQ9Y2L6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FRMD4BQ9Y2L6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FRMD4BQ9Y2L6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FRMD4BQ9Y2L6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FRMD4BQ9Y2L6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FRMD4BQ9Y2L6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms