Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRAPPC4Q9Y296 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms