Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRIM35Q9UPQ4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM35Q9UPQ4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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