Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VPS4AQ9UN37 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VPS4AQ9UN37 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms