Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCAN3Q9UKA8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCAN3Q9UKA8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms