Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GPN3Q9UHW5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms