Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ABRACLQ9P1F3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms