Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SH3BP4Q9P0V3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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