Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF12Q9NZN5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
ARHGEF12Q9NZN5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ARHGEF12Q9NZN5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ARHGEF12Q9NZN5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF12Q9NZN5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF12Q9NZN5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF12Q9NZN5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms