Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
EHD3Q9NZN3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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