Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms