Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM106BQ9NUM4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms