Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMILIN3Q9NT22 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms