Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQQ7

SLC35C2, Solute carrier family 35 member C2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C2Q9NQQ7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SLC35C2Q9NQQ7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms