Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms