Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLSPNQ9HAW4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms