Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF2Q9HAU5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms