Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
XKR8Q9H6D3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
XKR8Q9H6D3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms