Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MIXL1Q9H2W2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms